Cheminiu požiūriu fondaparinuksas yra sintetinis sulfato pentasacharidas, kurio cheminė struktūra pagrįsta aktyvia nefrakcionuoto heparino dalimi.
Kad fondaparinuksas veiktų, jis, kaip ir kiti heparino vaistai, turi būti vartojamas parenteraliai, ypač injekcijomis po oda. Tačiau kai kuriais atvejais veikliąją medžiagą taip pat gali švirkšti į veną specializuotas medicinos personalas.
Italijoje fondaparinuksas tiekiamas viename vaistiniame preparate, pavadintame „Arixrtra®“. Vaistas yra paruošto naudoti injekcinio tirpalo, esančio užpildytuose švirkštuose. Šio vaisto išleidimui reikalingas receptas. pakartotinas; tačiau kadangi jis yra klasifikuojamas kaip A klasės vaistas, jo kainą (tikrai didelę) gali kompensuoti Nacionalinė sveikatos sistema (NHS).
