ir infekcijos plitimo būdai gali būti skirtingi. Patogenų sukelta kolonizacija iš tikrųjų gali vykti:
- Didėjantis kelias iš šlapimo pūslės (dažniausiai): iš tarpvietės (arba iš makšties prieškambario, jei pacientė yra moteris), mikroorganizmai pakyla į šlaplę, paskui į šlapimo pūslę, iki inkstų; pagrindinės priežastys moterų infekciją sudaro šlaplės deformacija lytinių santykių metu, o vyrams tai dažnai būna antrinė prostatito priežastis. Kateterizuotiems pacientams užteršimas gali atsirasti po kateterio padėties nustatymo ar manipuliavimo, todėl patogenai gali patekti į šlapimo pūslę .
- Kraujo mažėjimo kelias: per kraują, esant septicemijai, patogenai pasiekia inkstus, sukeldami nefritą ir inkstų abscesus.
- Mažėjantis limfinis kelias: limfinių kraujagyslių tinklas jungia kylančią storąją žarną su dešiniuoju inkstu, o mažėjančią - su kairiuoju inkstu.
Pielonefritą sukeliantys mikroorganizmai dažniausiai yra tie patys, kurie yra atsakingi už šlapimo takų, lytinių organų ir virškinimo trakto infekcijas, todėl šlapimo pūslėje, prostatoje, gimdos kaklelyje, makštyje, šlaplėje ar tiesiojoje žarnoje: Escherichia coli, Klebsiella spp., Proteus spp., Enterococcus spp. ir kt.
Daugeliu atvejų šie patogenai yra išmatų floros bakterijos, kurios eina didėjančiu keliu, nors apskritai peristaltika (susitraukimų judesiai ir šlapimo takų sienelių išsiplėtimas) atlieka „veiksmingą apsauginį poveikį nuo infekcijų“.
Retkarčiais pranešama apie kitus neįprastus mikroorganizmus: mikobakterijas, mieles ir grybelius, taip pat oportunistinius patogenus, tokius kaip Corynebacterium urealyticum.
